Les premières thérapies comportementales et cognitives ont été mises au point pour des personnes souffrant de phobies et pour le traitement de la dépression.
Aujourd'hui, des protocoles de prise en charge par de thérapies comportementales et cognitives ont été décrits pour de nombreux troubles anxieux et dépressifs, ainsi que tous les troubles alimentaires, relationnels.
Avec l'apport de la thérapie des schémas, les difficultés de personalité sont également prises en charge.
En voici une liste :